41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2325 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  86.9 
 
 
145 aa  254  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0410  hypothetical protein  44.31 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  42.54 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  36.22 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  37.88 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  43.8 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  37.12 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  36.36 
 
 
444 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  35.07 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  35.82 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  32.09 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  41.32 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  41.32 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  41.32 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  32.84 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  43.3 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  29.1 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  30.08 
 
 
189 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  32.46 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0670  protein of unknown function DUF420  36.79 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0707  hypothetical protein  29.58 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1177  hypothetical protein  28.24 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1199  hypothetical protein  28.24 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0989  protein of unknown function DUF420  29.86 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  31.75 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1194  protein of unknown function DUF420  32.62 
 
 
200 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2961  protein of unknown function DUF420  33.06 
 
 
220 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
406 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2804  protein of unknown function DUF420  32.23 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1158  protein of unknown function DUF420  32.8 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>