41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0516 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  44.69 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  44.15 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  40.64 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  40.64 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  45.75 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  43.82 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  41.48 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  40.11 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  40.11 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  39.57 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  39.57 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  37.64 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  39.07 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  35.37 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  33.33 
 
 		 444 aa  87.8  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0410  hypothetical protein  33.55 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  38.06 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  38.81 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  30.41 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0989  protein of unknown function DUF420  29.41 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  35.82 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2961  protein of unknown function DUF420  29.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  28.08 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3296  protein of unknown function DUF420  27.21 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0707  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0670  protein of unknown function DUF420  44.07 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1194  protein of unknown function DUF420  29.49 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0654  protein of unknown function DUF420  29.14 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454771  normal  0.0604511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2804  protein of unknown function DUF420  29.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1177  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1199  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>