40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3020 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  100 
 
 		 190 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  52 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  49.72 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  49.72 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  49.72 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  44.83 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  41.21 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  46.21 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  42.96 
 
 		 181 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  38.73 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  43.7 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  40.64 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  37.66 
 
 		 444 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  39.1 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  38.33 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  35 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  34.17 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  34.17 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  30.25 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0410  hypothetical protein  34.01 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0989  protein of unknown function DUF420  28.47 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0707  hypothetical protein  29.29 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  29.46 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0671  protein of unknown function DUF420  27.37 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0670  protein of unknown function DUF420  29.21 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1177  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1199  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1158  protein of unknown function DUF420  24.44 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1474  protein of unknown function DUF420  25.16 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2961  protein of unknown function DUF420  26.81 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>