44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3463 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  63.13 
 
 
180 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  54.82 
 
 
181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  42.31 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  47.14 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  38.07 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  38.29 
 
 
180 aa  128  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  38.29 
 
 
180 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  37.71 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  37.71 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  42.26 
 
 
178 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  38.73 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  38.78 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  37.32 
 
 
444 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  37.64 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  38.94 
 
 
155 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  36 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3296  protein of unknown function DUF420  38.03 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  32.84 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1194  protein of unknown function DUF420  36.36 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0989  protein of unknown function DUF420  30.08 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  31.34 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0410  hypothetical protein  32.39 
 
 
159 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2961  protein of unknown function DUF420  33.82 
 
 
220 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0654  protein of unknown function DUF420  32.92 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454771  normal  0.0604511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  29.75 
 
 
142 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  31.54 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  29.75 
 
 
142 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  29.75 
 
 
142 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0707  hypothetical protein  26.92 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2804  protein of unknown function DUF420  29.78 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1199  hypothetical protein  27.69 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1177  hypothetical protein  27.69 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0671  protein of unknown function DUF420  27.44 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0670  protein of unknown function DUF420  27.78 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1158  protein of unknown function DUF420  27.46 
 
 
187 aa  44.3  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2094  protein of unknown function DUF420  25.69 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.853374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>