25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0599 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0599    100 
 
 		 456 bp  904    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0546461  normal  0.180658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0595    83.37 
 
 		 456 bp  276  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.582139  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0590    83.29 
 
 		 456 bp  272  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.477181  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0579    81.37 
 
 		 456 bp  206  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000820232  unclonable  0.00000279378 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3519    83.96 
 
 		 264 bp  151  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  93.62 
 
 		 1605 bp  69.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0174  magnesium chelatase ChlI subunit  88.68 
 
 		 537 bp  58  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.594218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  89.58 
 
 		 1542 bp  56  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  96.77 
 
 		 681 bp  54  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3762    96.77 
 
 		 701 bp  54  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  96.77 
 
 		 1515 bp  54  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  92.11 
 
 		 1533 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 1548 bp  52  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 1530 bp  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  84.29 
 
 		 1515 bp  52  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  96.55 
 
 		 1335 bp  50.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  91.89 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  91.89 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  90 
 
 		 1578 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  93.75 
 
 		 1509 bp  48.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  96.3 
 
 		 1650 bp  46.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  93.55 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 		 939 bp  46.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  96.3 
 
 		 1521 bp  46.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  89.74 
 
 		 1542 bp  46.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>