23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0590 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0590    100 
 
 
456 bp  904    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.477181  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0595    84.14 
 
 
456 bp  329  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.582139  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3519    89.07 
 
 
264 bp  276  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0599    83.29 
 
 
456 bp  272  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0546461  normal  0.180658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0579    85.16 
 
 
456 bp  125  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000820232  unclonable  0.00000279378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  95 
 
 
1605 bp  63.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  97.14 
 
 
1533 bp  61.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  96.88 
 
 
1530 bp  56  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  92.5 
 
 
1551 bp  56  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0120  ATPase with chaperone activity-like protein  90.48 
 
 
273 bp  52  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0137  magnesium chelatase, ChlI subunit  90.48 
 
 
558 bp  52  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  96.55 
 
 
681 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  96.55 
 
 
1335 bp  50.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3762    96.55 
 
 
701 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  96.55 
 
 
1515 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  91.89 
 
 
1539 bp  50.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  91.89 
 
 
1539 bp  50.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  87.5 
 
 
1542 bp  48.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  93.75 
 
 
1710 bp  48.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
1554 bp  48.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  93.75 
 
 
1533 bp  48.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
939 bp  46.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  96.3 
 
 
1521 bp  46.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>