25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0579 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0579    100 
 
 
456 bp  904    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000820232  unclonable  0.00000279378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0599    81.37 
 
 
456 bp  206  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0546461  normal  0.180658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0595    79.14 
 
 
456 bp  145  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.582139  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0590    85.16 
 
 
456 bp  125  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.477181  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3519    87.85 
 
 
264 bp  109  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0174  magnesium chelatase ChlI subunit  94.34 
 
 
537 bp  81.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.594218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0120  ATPase with chaperone activity-like protein  92.31 
 
 
273 bp  71.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0137  magnesium chelatase, ChlI subunit  92.31 
 
 
558 bp  71.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  94.29 
 
 
1554 bp  54  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  94.12 
 
 
681 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  84.29 
 
 
1542 bp  52  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3762    94.12 
 
 
701 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
1515 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  90.48 
 
 
1545 bp  52  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
1521 bp  50.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  93.94 
 
 
1533 bp  50.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  96.43 
 
 
1539 bp  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0193    84.38 
 
 
483 bp  48.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  88.64 
 
 
1536 bp  48.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  91.67 
 
 
1488 bp  48.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  96.3 
 
 
1539 bp  46.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  91.43 
 
 
1605 bp  46.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  93.55 
 
 
1554 bp  46.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
1533 bp  46.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  100 
 
 
1227 bp  46.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>