33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1616 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  99.12 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  98.68 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  85.9 
 
 		 227 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  59.91 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  35.24 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  36.12 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  35.24 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  34.67 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  39.63 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  33.92 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  33.63 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  35.85 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  34.26 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  32.09 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  33.49 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  32.16 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  34.93 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  33.33 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  32.55 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  33.33 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  31.34 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  34.72 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  30.7 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  31.6 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  30.7 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  30.74 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  29.49 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  32.79 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  32.07 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  27.63 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  28.07 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  26.01 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>