33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0237 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  100 
 
 
221 aa  448  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  36.07 
 
 
226 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  38.6 
 
 
223 aa  143  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  38.46 
 
 
223 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  35.16 
 
 
221 aa  137  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  32.42 
 
 
221 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  35.75 
 
 
223 aa  135  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  30.77 
 
 
221 aa  124  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  34.47 
 
 
221 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  32.66 
 
 
221 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  34.67 
 
 
221 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  31.51 
 
 
220 aa  122  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  33.17 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  37.43 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  32.52 
 
 
221 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  32.52 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  35.5 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  30.48 
 
 
245 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  31.07 
 
 
221 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  32.72 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  30.88 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  32.69 
 
 
220 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  33.02 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  33.02 
 
 
227 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  33.49 
 
 
227 aa  105  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  32.55 
 
 
227 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  31.64 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  35.33 
 
 
256 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  30.77 
 
 
249 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  29.58 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  27.98 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  27.36 
 
 
221 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  27.96 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>