33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0235 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  100 
 
 
221 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  92.76 
 
 
221 aa  408  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  70.14 
 
 
221 aa  310  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  67.87 
 
 
221 aa  299  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  70.59 
 
 
221 aa  299  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  50.45 
 
 
221 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  45.75 
 
 
219 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  42.99 
 
 
221 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  45.37 
 
 
220 aa  174  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  43.69 
 
 
221 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  43.33 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  41.89 
 
 
220 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  36.49 
 
 
218 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  40 
 
 
222 aa  147  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  37.96 
 
 
245 aa  135  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  34.43 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  34.25 
 
 
223 aa  128  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  35.62 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  37.1 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  34.09 
 
 
223 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  38.86 
 
 
221 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  36.32 
 
 
223 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  34.53 
 
 
227 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  33.18 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  34.53 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  33.92 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  32.52 
 
 
221 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  34.86 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  34.86 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  36.02 
 
 
221 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  36.74 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  35.55 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  33.33 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>