33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0028 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  41.74 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  39.27 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  39.27 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  38.64 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  39.63 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  39.17 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  38.64 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  37.61 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  35.75 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  37.56 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  38.64 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  35.16 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  38.71 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  37.33 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  36.07 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  35.94 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  34.84 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  34.7 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  36.36 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  35.94 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  34.13 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  34.25 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  36.4 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  36.26 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  32.72 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  35.37 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  35.81 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  32.72 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  32.09 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  34.93 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  31.65 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  34.65 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>