33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0113 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  100 
 
 
217 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  59.91 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  51.85 
 
 
221 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  47.3 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  47.12 
 
 
221 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  45.41 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  44.71 
 
 
221 aa  165  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  43.33 
 
 
221 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  41.83 
 
 
221 aa  161  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  42.47 
 
 
220 aa  158  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  41.89 
 
 
222 aa  156  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  39.63 
 
 
218 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  40.54 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  41.43 
 
 
221 aa  147  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  36.07 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  36.99 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  36.79 
 
 
227 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  33.49 
 
 
226 aa  116  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  32.52 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  35.85 
 
 
227 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  35.85 
 
 
227 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  30.59 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  35.85 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  31.88 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  35.38 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  33.33 
 
 
256 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  32.37 
 
 
247 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  32.85 
 
 
245 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  35.65 
 
 
221 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  32.85 
 
 
249 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  31.94 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  31.48 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  29.63 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>