16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2310 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2310  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.164046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  57.69 
 
 
411 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  57.14 
 
 
430 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  50.94 
 
 
440 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  55.1 
 
 
430 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  48.15 
 
 
420 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  49.06 
 
 
440 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  46.67 
 
 
419 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  42.86 
 
 
412 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  42.11 
 
 
429 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  40.85 
 
 
405 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  43.1 
 
 
430 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  44.64 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  44.23 
 
 
435 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  50 
 
 
417 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  36.99 
 
 
431 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>