26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3056 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3056  ZPR1-related zinc finger protein  100 
 
 
174 aa  351  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0090  ZPR1-related zinc finger protein  52.69 
 
 
179 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0399  ZPR1-related zinc finger protein  50 
 
 
174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.233414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0146  hypothetical protein  43.98 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0793146  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0757  ZPR1-like zinc finger protein  44.97 
 
 
195 aa  136  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0233  ZPR1-related zinc finger protein  40 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1227  ZPR1-related zinc finger protein  43.29 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0132  ZPR1-related zinc finger protein  42.86 
 
 
190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.359877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0691  ZPR1-like zinc finger protein  42.86 
 
 
190 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.645415  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0180  hypothetical protein  40.25 
 
 
213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0355  ZPR1-related zinc finger protein  43.31 
 
 
198 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1437  ZPR1-related zinc finger protein  38.69 
 
 
191 aa  120  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0189  ZPR1-like zinc finger protein  36.81 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0833156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0727  ZPR1-related zinc finger protein  38.12 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0636702  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0232  ZPR1-related zinc finger protein  39.51 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0475  ZPR1-related zinc finger protein  33.97 
 
 
192 aa  87  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000000108439  hitchhiker  0.000534132 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0641  ZPR1-related zinc finger protein  33.54 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.205749  normal  0.261056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0649  ZPR1-related zinc finger protein  33.33 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000551217  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0146  ZPR1-like zinc finger protein  32.08 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37460  nucleolar zinc-finger protein  27.37 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0530225  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0729  ZPR1-like zinc finger protein  32.28 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.772749  normal  0.600109 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0161  ZPR1-like zinc finger protein  29.11 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02800  zinc-finger protein zpr1, putative  28.49 
 
 
522 aa  67  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1210  ZPR1-like zinc finger protein  30.36 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.4233  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02455  essential protein with two zinc fingers (Eurofung)  27.44 
 
 
463 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25298  predicted protein  25.43 
 
 
505 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>