26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0146 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0146  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0793146  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0399  ZPR1-related zinc finger protein  51.15 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.233414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0090  ZPR1-related zinc finger protein  49.14 
 
 
179 aa  174  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0233  ZPR1-related zinc finger protein  47.95 
 
 
175 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0189  ZPR1-like zinc finger protein  45.09 
 
 
221 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0833156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1437  ZPR1-related zinc finger protein  41.34 
 
 
191 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0180  hypothetical protein  44.97 
 
 
213 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3056  ZPR1-related zinc finger protein  43.98 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1227  ZPR1-related zinc finger protein  37.5 
 
 
190 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0727  ZPR1-related zinc finger protein  35.71 
 
 
191 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0636702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0691  ZPR1-like zinc finger protein  36.59 
 
 
190 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.645415  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0132  ZPR1-related zinc finger protein  36.59 
 
 
190 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.359877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0355  ZPR1-related zinc finger protein  33.74 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0757  ZPR1-like zinc finger protein  32.5 
 
 
195 aa  89  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0232  ZPR1-related zinc finger protein  36.25 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0649  ZPR1-related zinc finger protein  30.54 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000551217  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0641  ZPR1-related zinc finger protein  33.54 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.205749  normal  0.261056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0146  ZPR1-like zinc finger protein  29.49 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37460  nucleolar zinc-finger protein  27.44 
 
 
497 aa  68.2  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0530225  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0475  ZPR1-related zinc finger protein  28.83 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000000108439  hitchhiker  0.000534132 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0729  ZPR1-like zinc finger protein  29.7 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.772749  normal  0.600109 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02455  essential protein with two zinc fingers (Eurofung)  25 
 
 
463 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02800  zinc-finger protein zpr1, putative  27.65 
 
 
522 aa  62.4  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0161  ZPR1-like zinc finger protein  28.21 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25298  predicted protein  26.94 
 
 
505 aa  58.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1210  ZPR1-like zinc finger protein  26.75 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.4233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>