25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0641 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0641  ZPR1-related zinc finger protein  100 
 
 
168 aa  346  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.205749  normal  0.261056 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0232  ZPR1-related zinc finger protein  54.88 
 
 
174 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0475  ZPR1-related zinc finger protein  32.35 
 
 
192 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000000108439  hitchhiker  0.000534132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3056  ZPR1-related zinc finger protein  33.54 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0355  ZPR1-related zinc finger protein  33.12 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0146  ZPR1-like zinc finger protein  31.58 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0399  ZPR1-related zinc finger protein  32.3 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.233414 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1210  ZPR1-like zinc finger protein  32.89 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.4233  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0146  hypothetical protein  33.54 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0793146  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0090  ZPR1-related zinc finger protein  30.12 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0161  ZPR1-like zinc finger protein  29.61 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1227  ZPR1-related zinc finger protein  30.49 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0132  ZPR1-related zinc finger protein  29.27 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.359877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0691  ZPR1-like zinc finger protein  31.1 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.645415  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0729  ZPR1-like zinc finger protein  31.17 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.772749  normal  0.600109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0189  ZPR1-like zinc finger protein  28.74 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0833156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0180  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0233  ZPR1-related zinc finger protein  28.3 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0649  ZPR1-related zinc finger protein  29.33 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000551217  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0727  ZPR1-related zinc finger protein  28.03 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0636702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0757  ZPR1-like zinc finger protein  28.92 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37460  nucleolar zinc-finger protein  30.6 
 
 
497 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0530225  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1437  ZPR1-related zinc finger protein  26.79 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25298  predicted protein  25.52 
 
 
505 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02455  essential protein with two zinc fingers (Eurofung)  27.01 
 
 
463 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>