26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0146 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0146  ZPR1-like zinc finger protein  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0161  ZPR1-like zinc finger protein  74.42 
 
 
174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1210  ZPR1-like zinc finger protein  71.68 
 
 
175 aa  266  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.4233  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0729  ZPR1-like zinc finger protein  71.68 
 
 
175 aa  256  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.772749  normal  0.600109 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0475  ZPR1-related zinc finger protein  43.21 
 
 
192 aa  148  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000000108439  hitchhiker  0.000534132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0233  ZPR1-related zinc finger protein  33.91 
 
 
175 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0355  ZPR1-related zinc finger protein  34.18 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1227  ZPR1-related zinc finger protein  31.61 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0727  ZPR1-related zinc finger protein  31.58 
 
 
191 aa  88.2  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0636702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1437  ZPR1-related zinc finger protein  34.52 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0399  ZPR1-related zinc finger protein  35.67 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.233414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0232  ZPR1-related zinc finger protein  29.94 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0649  ZPR1-related zinc finger protein  35.8 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000551217  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0691  ZPR1-like zinc finger protein  32.08 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.645415  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0090  ZPR1-related zinc finger protein  33.75 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0132  ZPR1-related zinc finger protein  30.32 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.359877  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0757  ZPR1-like zinc finger protein  31.01 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3056  ZPR1-related zinc finger protein  32.08 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0189  ZPR1-like zinc finger protein  32.1 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0833156  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0641  ZPR1-related zinc finger protein  31.58 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.205749  normal  0.261056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0180  hypothetical protein  30.43 
 
 
213 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0146  hypothetical protein  29.49 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0793146  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37460  nucleolar zinc-finger protein  27.38 
 
 
497 aa  65.5  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0530225  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25298  predicted protein  27.57 
 
 
505 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02455  essential protein with two zinc fingers (Eurofung)  26.14 
 
 
463 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02800  zinc-finger protein zpr1, putative  30.09 
 
 
522 aa  58.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>