More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1310 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  87.13 
 
 
101 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  72.28 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  70.3 
 
 
101 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  73.27 
 
 
101 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  67.33 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  63.37 
 
 
101 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  62.38 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  66.34 
 
 
98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  60.4 
 
 
101 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 
101 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  61.39 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
100 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
115 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
89 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1220  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1183  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.552598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  47.06 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0599  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.118068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0999  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0161661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  50.5 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0279  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000854327  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0422  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1345  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000233986  normal  0.0693599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>