35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1481 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1481  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0997  peptidyl-tRNA hydrolase  91.38 
 
 
116 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.872117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1631  peptidyl-tRNA hydrolase  90.52 
 
 
116 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.61994  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0283  peptidyl-tRNA hydrolase  90.52 
 
 
116 aa  218  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1251  peptidyl-tRNA hydrolase  66.38 
 
 
116 aa  166  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0684  peptidyl-tRNA hydrolase  53.1 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.577357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  47.79 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0804  peptidyl-tRNA hydrolase  50.43 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.425499  hitchhiker  0.000240374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0905  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 
120 aa  107  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000145084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 
112 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1400  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
120 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0809  peptidyl-tRNA hydrolase  49.57 
 
 
120 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0451427  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3204  peptidyl-tRNA hydrolase  49.57 
 
 
115 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.989283  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1277  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 
115 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  44.35 
 
 
120 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0826773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
112 aa  103  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0207  peptidyl-tRNA hydrolase  45.13 
 
 
117 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.0587052 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1153  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
120 aa  100  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0865  peptidyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 
114 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1200  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  44.35 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13158  predicted protein  39.64 
 
 
114 aa  89.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44311  predicted protein  36.84 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.701325  normal  0.717756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1284  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.54 
 
 
113 aa  87  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  38.74 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64167  predicted protein  37.61 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  0.876007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.07 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.848355 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10249  mitochondrial peptidyl-tRNA hydrolase Pth2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10430)  40.35 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167558  normal  0.131659 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  38.94 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.614979  normal  0.635641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2123  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1991  peptidyl-tRNA hydrolase  38.94 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0308  protein of unknown function UPF0099  36.23 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00118804  normal  0.388364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7201  hypothetical protein  32.65 
 
 
230 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312611  normal  0.134571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>