34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0308 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0308  protein of unknown function UPF0099  100 
 
 		 146 aa  303  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00118804  normal  0.388364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0997  peptidyl-tRNA hydrolase  37.68 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.872117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1631  peptidyl-tRNA hydrolase  37.68 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.61994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  36.23 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0826773 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0283  peptidyl-tRNA hydrolase  37.68 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1251  peptidyl-tRNA hydrolase  32.85 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0684  peptidyl-tRNA hydrolase  35.25 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.577357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1481  peptidyl-tRNA hydrolase  36.5 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  35.71 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1277  peptidyl-tRNA hydrolase  35.04 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.53 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  35.25 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1153  Aminoacyl-tRNA hydrolase  33.81 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  34.53 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  34.53 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0804  peptidyl-tRNA hydrolase  33.57 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.425499  hitchhiker  0.000240374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0207  peptidyl-tRNA hydrolase  31.65 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.0587052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0905  peptidyl-tRNA hydrolase  31.25 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000145084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0809  peptidyl-tRNA hydrolase  32.14 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0451427  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  33.81 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1400  peptidyl-tRNA hydrolase  30.82 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0865  peptidyl-tRNA hydrolase  30.43 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3204  peptidyl-tRNA hydrolase  31.39 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.989283  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1284  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.81 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1200  peptidyl-tRNA hydrolase  33.57 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44311  predicted protein  33.81 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.701325  normal  0.717756 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10249  mitochondrial peptidyl-tRNA hydrolase Pth2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10430)  29.2 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167558  normal  0.131659 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64167  predicted protein  30.94 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  0.876007 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2123  peptidyl-tRNA hydrolase  36.43 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  34.53 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.614979  normal  0.635641 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1991  peptidyl-tRNA hydrolase  35 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2354  peptidyl-tRNA hydrolase  29.93 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.848355 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  27.97 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13158  predicted protein  25.69 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>