36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1400 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1400  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0905  peptidyl-tRNA hydrolase  77.19 
 
 		 120 aa  187  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000145084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0809  peptidyl-tRNA hydrolase  73.91 
 
 		 120 aa  183  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0451427  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  69.17 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0804  peptidyl-tRNA hydrolase  66.96 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.425499  hitchhiker  0.000240374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0865  peptidyl-tRNA hydrolase  55.86 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  55.86 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  54.95 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3204  peptidyl-tRNA hydrolase  52.21 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.989283  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  53.64 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  52.73 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1277  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0997  peptidyl-tRNA hydrolase  44.35 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.872117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1631  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.61994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0283  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1251  peptidyl-tRNA hydrolase  46.96 
 
 		 116 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1481  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0826773 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1284  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.75 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1153  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0684  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.577357  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0207  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.0587052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.82 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.848355 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  45.22 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.614979  normal  0.635641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1200  peptidyl-tRNA hydrolase  42.98 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1991  peptidyl-tRNA hydrolase  46.09 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44311  predicted protein  41.18 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.701325  normal  0.717756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2123  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64167  predicted protein  36.13 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  0.876007 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13158  predicted protein  35.96 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  32.28 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10249  mitochondrial peptidyl-tRNA hydrolase Pth2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10430)  36.75 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167558  normal  0.131659 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0308  protein of unknown function UPF0099  30.61 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00118804  normal  0.388364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7201  hypothetical protein  35.48 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312611  normal  0.134571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1324  protein of unknown function UPF0099  30 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>