24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7201 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7201  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312611  normal  0.134571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1324  protein of unknown function UPF0099  66.82 
 
 		 261 aa  261  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0991  protein of unknown function UPF0099  48.56 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3414  hypothetical protein  47.34 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331031  normal  0.0835917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3348  protein of unknown function UPF0099  42.52 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29290  Peptidyl-tRNA hydrolase PTH2  42.79 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.820939  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1689  protein of unknown function UPF0099  39.22 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765723  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2875  protein of unknown function UPF0099  43.48 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3279  protein of unknown function UPF0099  41.15 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4389  protein of unknown function UPF0099  30.19 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0873126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0905  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 		 120 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000145084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  37.93 
 
 		 112 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1400  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 		 120 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0809  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 120 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0451427  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  33.67 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0283  peptidyl-tRNA hydrolase  32.65 
 
 		 116 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0997  peptidyl-tRNA hydrolase  32.65 
 
 		 116 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.872117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.63 
 
 		 112 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  38.2 
 
 		 112 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1631  peptidyl-tRNA hydrolase  31.63 
 
 		 116 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.61994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1481  peptidyl-tRNA hydrolase  32.65 
 
 		 116 aa  45.4  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.48 
 
 		 112 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>