18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0991 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0991  protein of unknown function UPF0099  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29290  Peptidyl-tRNA hydrolase PTH2  58.37 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.820939  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1324  protein of unknown function UPF0099  48.6 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7201  hypothetical protein  48.56 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312611  normal  0.134571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1689  protein of unknown function UPF0099  46.78 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765723  normal  0.0247017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3348  protein of unknown function UPF0099  46.38 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3414  hypothetical protein  45.71 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331031  normal  0.0835917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2875  protein of unknown function UPF0099  47.3 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3279  protein of unknown function UPF0099  45.54 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4389  protein of unknown function UPF0099  30.49 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0873126 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44311  predicted protein  38.18 
 
 		 135 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.701325  normal  0.717756 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  32.65 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  34.04 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  38.64 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  34.09 
 
 		 112 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>