15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2936 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2936  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  362  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2036  hypothetical protein  42.18 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0871  hypothetical protein  39.62 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0544539  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2903  hypothetical protein  36.14 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.700783  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4204  hypothetical protein  34.27 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0964  hypothetical protein  35.09 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  29.71 
 
 		 174 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0601  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.38 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.85 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  24.82 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3674  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.12 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  23.49 
 
 		 179 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.69 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.428126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>