14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2903 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  355  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.700783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2936  hypothetical protein  36.14 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2036  hypothetical protein  38.13 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4204  hypothetical protein  34.23 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0871  hypothetical protein  34.52 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0544539  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  31.3 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0964  hypothetical protein  30.51 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  53.19 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.428126  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.22 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0885  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.43 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000127189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1556  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.79 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3171  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  33.33 
 
 		 173 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3156  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.97 
 
 		 176 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  23.21 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>