22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0505 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  718    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  25.4 
 
 
356 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  30.64 
 
 
366 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3580  hypothetical protein  28.06 
 
 
437 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  28.05 
 
 
348 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  25.52 
 
 
357 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0555  hypothetical protein  27.54 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  26.89 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  25.54 
 
 
348 aa  92.8  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  24.43 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1443  hypothetical protein  26.02 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  26.71 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1373  hypothetical protein  25.8 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1429  hypothetical protein  25.57 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000000396123  hitchhiker  0.0000000653415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  25.59 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  23.95 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2773  hypothetical protein  26.98 
 
 
345 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642694  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1292  hypothetical protein  22.89 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.00000000239606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2124  secretin/TonB short domain  27.66 
 
 
575 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0909641  normal  0.0183027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0865  hypothetical protein  30.58 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  22.42 
 
 
634 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1426  hypothetical protein  29.25 
 
 
220 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0374687  hitchhiker  0.000000160799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>