20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0555 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0555  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  676    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  45.13 
 
 
356 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  46.15 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  41.69 
 
 
366 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  40.82 
 
 
348 aa  189  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  26.93 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1443  hypothetical protein  29.72 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  28.91 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  26.11 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  28.29 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0114  hypothetical protein  25.27 
 
 
291 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0503124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  27.13 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0865  hypothetical protein  35.42 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  28.43 
 
 
634 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1373  hypothetical protein  27.19 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  22.75 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  25.2 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3580  hypothetical protein  26.09 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1429  hypothetical protein  24.6 
 
 
439 aa  46.2  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000000396123  hitchhiker  0.0000000653415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2176  hypothetical protein  28.66 
 
 
587 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>