16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3580 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  822    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1373  hypothetical protein  68.69 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  26.23 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  27.05 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  32.02 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  29.48 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  24.03 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  29.75 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  25.42 
 
 		 354 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  53.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1443  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  30.21 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0579  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.154371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0594  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000844935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  26.3 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3435  hypothetical protein  28.81 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>