16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2773 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642694  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  27.57 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  25.46 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  26.29 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  25.67 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  23.77 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  27.91 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  27.15 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0555  hypothetical protein  27.11 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  26.67 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 634 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  27.74 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1443  hypothetical protein  23.29 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1292  hypothetical protein  21.31 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.00000000239606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2176  hypothetical protein  35.51 
 
 		 587 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>