14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1256 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  658    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  38.61 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1292  hypothetical protein  33.75 
 
 
331 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.00000000239606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  32.81 
 
 
344 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  31.37 
 
 
354 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
356 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  25.54 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  33.05 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  28.77 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  27.87 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1429  hypothetical protein  31.3 
 
 
439 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000000396123  hitchhiker  0.0000000653415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  23.24 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3580  hypothetical protein  29.6 
 
 
437 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0555  hypothetical protein  26.21 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>