13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1292 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1292  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.00000000239606  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  39.2 
 
 
326 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  33.75 
 
 
348 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  23.94 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  22.57 
 
 
356 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  23.98 
 
 
373 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1443  hypothetical protein  25.19 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  25.8 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2773  hypothetical protein  21.13 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642694  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  20.92 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  26.17 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  29.58 
 
 
2061 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>