15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1429 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1429  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  859    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000000396123  hitchhiker  0.0000000653415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0505  hypothetical protein  28.12 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.366636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  26.4 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1426  hypothetical protein  36.75 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0374687  hitchhiker  0.000000160799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1428  hypothetical protein  31.88 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477641  decreased coverage  0.0000000110484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  33.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1256  hypothetical protein  31.3 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  25.23 
 
 
348 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0804  hypothetical protein  30.65 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0114  hypothetical protein  23.97 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0503124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1292  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.00000000239606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3580  hypothetical protein  23.85 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0532  hypothetical protein  22.39 
 
 
344 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0154815  normal  0.55787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>