57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0367 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
160 aa  322  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  72.5 
 
 
178 aa  254  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  68.12 
 
 
167 aa  213  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  60 
 
 
191 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  59.12 
 
 
165 aa  200  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  58.13 
 
 
171 aa  197  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  58.75 
 
 
169 aa  196  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  56.88 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  56.88 
 
 
169 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  56.25 
 
 
169 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  55.35 
 
 
170 aa  191  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  55.62 
 
 
170 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  54.37 
 
 
169 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  58.13 
 
 
169 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  54.72 
 
 
170 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  55.62 
 
 
170 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  54.37 
 
 
175 aa  188  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  54.09 
 
 
170 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  54.09 
 
 
170 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  54.78 
 
 
396 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  56.96 
 
 
392 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.92 
 
 
393 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  52.56 
 
 
392 aa  157  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.5 
 
 
403 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.77 
 
 
393 aa  151  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  46.43 
 
 
178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  46.43 
 
 
178 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50.32 
 
 
393 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.68 
 
 
393 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  35.85 
 
 
190 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  36.97 
 
 
182 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  34.81 
 
 
174 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  40.36 
 
 
183 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  40.13 
 
 
179 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
179 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
179 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
181 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
179 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 
181 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
179 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 
177 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  37.34 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  37.34 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  37.67 
 
 
177 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  37.34 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 
181 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  35.44 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  35.58 
 
 
211 aa  90.9  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  33.74 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  31.71 
 
 
182 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  31.71 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  30.82 
 
 
178 aa  87  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  31.71 
 
 
182 aa  87  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  29.88 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  28.66 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.96 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  42.47 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>