57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3147 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  86.39 
 
 		 170 aa  306  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  85.03 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  80.24 
 
 		 169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  77.25 
 
 		 169 aa  278  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  76.92 
 
 		 170 aa  276  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  74.85 
 
 		 175 aa  259  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  71.86 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  71.26 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  68.86 
 
 		 171 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  68.86 
 
 		 171 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  66.47 
 
 		 170 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  66.47 
 
 		 170 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  66.47 
 
 		 170 aa  228  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  66.47 
 
 		 170 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  61.14 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  60.57 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  61.64 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  58.13 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  55.49 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  56.89 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  48.1 
 
 		 396 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  53.16 
 
 		 392 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.51 
 
 		 393 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.5 
 
 		 393 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  48.72 
 
 		 392 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.41 
 
 		 403 aa  125  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.13 
 
 		 393 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  43.95 
 
 		 393 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  35.98 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  34.76 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  50 
 
 		 119 aa  84  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  30.06 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  31.14 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  31.9 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  31.9 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  31.9 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  34.93 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  36.91 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  32.89 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  32.89 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  36.91 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  32.89 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  34.93 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  36.05 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  33.13 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  31.29 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  30.28 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.92 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  28.98 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  26.35 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  26.71 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.67 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.86 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  27.67 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  24.55 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>