56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3132 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  89.6 
 
 		 177 aa  330  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  86.21 
 
 		 177 aa  320  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  78.98 
 
 		 177 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  71.93 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  66.06 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  65.45 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  65.45 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  63.64 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  63.03 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  63.03 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  63.64 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  63.64 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  43.18 
 
 		 211 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  42.94 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  39.16 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  45.24 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  38.55 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  38.55 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  37.95 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  36.75 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.47 
 
 		 396 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  44.3 
 
 		 392 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  40.54 
 
 		 393 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  39.04 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  41.32 
 
 		 392 aa  97.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  39.76 
 
 		 403 aa  94.7  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  40.79 
 
 		 393 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  41.78 
 
 		 393 aa  87.8  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  40.14 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  38.1 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  39.26 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  37.67 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  34.97 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  36.2 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  38.03 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  35.98 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  35.29 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  35.98 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  37.41 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  36.05 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  33.82 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  31.65 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  36.05 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  33.8 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  29.5 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  31.18 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.12 
 
 		 391 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>