57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6487 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  89.35 
 
 		 169 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  83.83 
 
 		 170 aa  294  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  80.84 
 
 		 169 aa  289  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  78.44 
 
 		 170 aa  280  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  77.25 
 
 		 169 aa  278  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  75.15 
 
 		 175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 171 aa  261  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 171 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  71.86 
 
 		 169 aa  258  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  70.41 
 
 		 170 aa  254  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  70.41 
 
 		 170 aa  254  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  71.01 
 
 		 170 aa  253  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  71.26 
 
 		 191 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  71.01 
 
 		 170 aa  253  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  63.43 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  61.71 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  61.01 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  56.1 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  54.37 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  55.69 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.37 
 
 		 396 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.27 
 
 		 392 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  43.59 
 
 		 393 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.5 
 
 		 393 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.15 
 
 		 392 aa  133  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  43.95 
 
 		 403 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.86 
 
 		 393 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.5 
 
 		 393 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  58.75 
 
 		 119 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  29.19 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  29.7 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  34.43 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  34.43 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  32.39 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  34.25 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  31.51 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  28.75 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  31.69 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  33.74 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  29.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  31.69 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  30.28 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  30.61 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.49 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  27.49 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  27.91 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.49 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.44 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  26.22 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  27.43 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  28.48 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>