33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2778 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  56.25 
 
 		 191 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  58.75 
 
 		 169 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  55 
 
 		 170 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  53.75 
 
 		 169 aa  88.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  55 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  51.19 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  50 
 
 		 169 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  50 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  51.9 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  50.63 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  48.75 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  53.93 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  52.81 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  48.15 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  48.15 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  48.15 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  48.15 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  40.51 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  42.47 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  43.24 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  40 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  37.66 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.84 
 
 		 393 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.5 
 
 		 393 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38.89 
 
 		 393 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.25 
 
 		 392 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 		 403 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.25 
 
 		 392 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.26 
 
 		 396 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  33.33 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>