42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1940 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1940  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176501  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0291  hypothetical protein  55.44 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2154  protein of unknown function DUF89  50.7 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1616  hypothetical protein  49.46 
 
 
284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0860  hypothetical protein  38.16 
 
 
285 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0849  hypothetical protein  39.52 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2187  hypothetical protein  36.43 
 
 
293 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0164  protein of unknown function DUF89  34.15 
 
 
284 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2876  protein of unknown function DUF89  31.16 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.649323  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0567  hypothetical protein  27.83 
 
 
307 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.584025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0772  hypothetical protein  29.5 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0344375  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0811  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0236896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0749  hypothetical protein  29.7 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.168528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0464  hypothetical protein  30.03 
 
 
284 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0197521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1030  protein of unknown function DUF89  30.12 
 
 
280 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0499  hypothetical protein  29.41 
 
 
298 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0338  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3221  hypothetical protein  29.77 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1420  hypothetical protein  29.74 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.636478  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0046  hypothetical protein  30.03 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2857  protein of unknown function DUF89  27.3 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1580  hypothetical protein  26.12 
 
 
291 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0920  hypothetical protein  33.48 
 
 
335 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0546  protein of unknown function DUF89  29.51 
 
 
280 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21010  hypothetical protein  26.86 
 
 
282 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0605  protein of unknown function DUF89  30.63 
 
 
290 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2453  protein of unknown function DUF89  27.74 
 
 
306 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000820322  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0818  hypothetical protein  35.35 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0388  hypothetical protein  29.96 
 
 
335 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347934  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1372  hypothetical protein  32.05 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1644  protein of unknown function DUF89  26.99 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1052  protein of unknown function DUF89  32.44 
 
 
287 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0482406  normal  0.221954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1536  hypothetical protein  28.26 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.637691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1861  hypothetical protein  23.69 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0170124  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1555  protein of unknown function DUF89  27.75 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502074  decreased coverage  0.0000247476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1577  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000180014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2904  hypothetical protein  24.37 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0602  hypothetical protein  22.6 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.058078  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0250  hypothetical protein  23.32 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.540172  normal  0.258484 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1738  hypothetical protein  27.68 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.500184  hitchhiker  0.00181566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1558  hypothetical protein  26.13 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0568  hypothetical protein  24.32 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.108249  hitchhiker  0.00320219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>