44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0291 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0291  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1940  hypothetical protein  55.44 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176501  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2154  protein of unknown function DUF89  50.53 
 
 
283 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1616  hypothetical protein  45.49 
 
 
284 aa  244  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0860  hypothetical protein  40.99 
 
 
285 aa  225  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0849  hypothetical protein  40.82 
 
 
291 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2187  hypothetical protein  38.01 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0164  protein of unknown function DUF89  35.86 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0811  hypothetical protein  28.04 
 
 
306 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0236896  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0567  hypothetical protein  26.21 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.584025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21010  hypothetical protein  28.91 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1030  protein of unknown function DUF89  30 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1420  hypothetical protein  26.94 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.636478  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0338  hypothetical protein  27 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0499  hypothetical protein  26.33 
 
 
298 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3221  hypothetical protein  29.14 
 
 
285 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1644  protein of unknown function DUF89  28.67 
 
 
287 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2876  protein of unknown function DUF89  32.89 
 
 
290 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.649323  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0772  hypothetical protein  27.72 
 
 
293 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0344375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0749  hypothetical protein  28.77 
 
 
293 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.168528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0546  protein of unknown function DUF89  28.42 
 
 
280 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1372  hypothetical protein  31.23 
 
 
275 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1580  hypothetical protein  27.46 
 
 
291 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0388  hypothetical protein  32.2 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347934  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1536  hypothetical protein  25.91 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.637691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0464  hypothetical protein  28.77 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0197521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0920  hypothetical protein  31.22 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1052  protein of unknown function DUF89  32.74 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0482406  normal  0.221954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0605  protein of unknown function DUF89  28.76 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2857  protein of unknown function DUF89  26.71 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0818  hypothetical protein  30.84 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0046  hypothetical protein  28.63 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1861  hypothetical protein  24.74 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0170124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2453  protein of unknown function DUF89  27.82 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000820322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1577  hypothetical protein  29.82 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000180014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1555  protein of unknown function DUF89  28.8 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502074  decreased coverage  0.0000247476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2904  hypothetical protein  29.22 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0602  hypothetical protein  21.92 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.058078  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0250  hypothetical protein  25.17 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.540172  normal  0.258484 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0568  hypothetical protein  25.18 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.108249  hitchhiker  0.00320219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1558  hypothetical protein  25.11 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1738  hypothetical protein  25.78 
 
 
264 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.500184  hitchhiker  0.00181566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1739  hypothetical protein  27.78 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.56613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2189  protein of unknown function DUF89  33.58 
 
 
382 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>