44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1580 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1580  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21010  hypothetical protein  35.36 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2876  protein of unknown function DUF89  35.92 
 
 
290 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.649323  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3221  hypothetical protein  37.36 
 
 
285 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0749  hypothetical protein  34.04 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.168528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0772  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0344375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0605  protein of unknown function DUF89  36.27 
 
 
290 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0388  hypothetical protein  37.55 
 
 
335 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347934  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0567  hypothetical protein  34.39 
 
 
307 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.584025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2904  hypothetical protein  35.25 
 
 
310 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1861  hypothetical protein  32.98 
 
 
285 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0170124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0811  hypothetical protein  32.09 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0236896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1555  protein of unknown function DUF89  36.4 
 
 
305 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502074  decreased coverage  0.0000247476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2453  protein of unknown function DUF89  37.28 
 
 
306 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000820322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0499  hypothetical protein  34.12 
 
 
298 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1536  hypothetical protein  29.93 
 
 
294 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.637691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0338  hypothetical protein  34.95 
 
 
298 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1420  hypothetical protein  34.6 
 
 
298 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.636478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1644  protein of unknown function DUF89  32.08 
 
 
287 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2857  protein of unknown function DUF89  40.72 
 
 
297 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1577  hypothetical protein  38.65 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000180014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1030  protein of unknown function DUF89  32.45 
 
 
280 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0920  hypothetical protein  36.01 
 
 
335 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1052  protein of unknown function DUF89  33.09 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0482406  normal  0.221954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0546  protein of unknown function DUF89  32.87 
 
 
280 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1372  hypothetical protein  35.41 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0164  protein of unknown function DUF89  33.8 
 
 
284 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2187  hypothetical protein  27.57 
 
 
293 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0602  hypothetical protein  27.18 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.058078  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0849  hypothetical protein  28.62 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125309  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1940  hypothetical protein  26.12 
 
 
284 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176501  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0464  hypothetical protein  30.29 
 
 
284 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0197521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0291  hypothetical protein  27.46 
 
 
285 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2154  protein of unknown function DUF89  28.18 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0860  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0046  hypothetical protein  26.21 
 
 
297 aa  92.4  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1616  hypothetical protein  25.59 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0250  hypothetical protein  27.46 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.540172  normal  0.258484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0818  hypothetical protein  29 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0568  hypothetical protein  27.73 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.108249  hitchhiker  0.00320219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1739  hypothetical protein  27.44 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.56613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1558  hypothetical protein  25.58 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1738  hypothetical protein  25.81 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.500184  hitchhiker  0.00181566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2617  hypothetical protein  26.54 
 
 
580 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>