43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1052 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1052  protein of unknown function DUF89  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0482406  normal  0.221954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3221  hypothetical protein  46.21 
 
 
285 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0388  hypothetical protein  49.57 
 
 
335 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347934  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21010  hypothetical protein  32.12 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1580  hypothetical protein  33.09 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2876  protein of unknown function DUF89  32.75 
 
 
290 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.649323  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0605  protein of unknown function DUF89  30.64 
 
 
290 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0772  hypothetical protein  30.21 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0344375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0749  hypothetical protein  30.56 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.168528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1030  protein of unknown function DUF89  33.92 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0811  hypothetical protein  28.38 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0236896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1644  protein of unknown function DUF89  33.45 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1861  hypothetical protein  29.41 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0170124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0920  hypothetical protein  34.36 
 
 
335 aa  125  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1555  protein of unknown function DUF89  39.44 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502074  decreased coverage  0.0000247476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2857  protein of unknown function DUF89  31.4 
 
 
297 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2904  hypothetical protein  35.14 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1536  hypothetical protein  25.42 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.637691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2453  protein of unknown function DUF89  36.15 
 
 
306 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000820322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2187  hypothetical protein  31.84 
 
 
293 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1577  hypothetical protein  35.84 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000180014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0164  protein of unknown function DUF89  29.03 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1940  hypothetical protein  32.23 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176501  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0291  hypothetical protein  29.45 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0499  hypothetical protein  28.71 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0546  protein of unknown function DUF89  29.33 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0338  hypothetical protein  28.71 
 
 
298 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1420  hypothetical protein  28.71 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.636478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0567  hypothetical protein  27.1 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.584025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1372  hypothetical protein  29.15 
 
 
275 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0602  hypothetical protein  26.46 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.058078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2154  protein of unknown function DUF89  29.06 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0464  hypothetical protein  32.87 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0197521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0849  hypothetical protein  28.03 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0046  hypothetical protein  30.67 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1616  hypothetical protein  31.16 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1558  hypothetical protein  24.32 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0818  hypothetical protein  30.39 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0250  hypothetical protein  26.94 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.540172  normal  0.258484 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0568  hypothetical protein  22.22 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.108249  hitchhiker  0.00320219 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0860  hypothetical protein  24.1 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1739  hypothetical protein  24.14 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.56613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1738  hypothetical protein  24.14 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.500184  hitchhiker  0.00181566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>