21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3823 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3823    100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  96.86 
 
 
405 bp  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  91.67 
 
 
255 bp  333  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  89.23 
 
 
405 bp  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  99.3 
 
 
234 bp  274  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  88.08 
 
 
405 bp  270  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3240  transposase  88.2 
 
 
195 bp  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.408915  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  89.61 
 
 
318 bp  178  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  88.96 
 
 
282 bp  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  88.31 
 
 
282 bp  163  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  90.11 
 
 
210 bp  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1974    89.01 
 
 
210 bp  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
318 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
372 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
564 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
318 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
318 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
402 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
402 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  90.91 
 
 
564 bp  56  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  88.64 
 
 
372 bp  48.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>