More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3162 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3162  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  157  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00204659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0043  hypothetical protein  96 
 
 
112 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1324  hypothetical protein  96 
 
 
75 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000817472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1328  hypothetical protein  96 
 
 
75 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1752  hypothetical protein  48.61 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3170  hypothetical protein  97.56 
 
 
41 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000334822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  48.39 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  48.65 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  48.65 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  48.65 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  48.65 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1554  hypothetical protein  47.27 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.228037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  90.91 
 
 
184 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  38.46 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2377  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2436  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2446  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.994659  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2533  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2578  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2587  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.940725  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2595  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00695571  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2700  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2795  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0430  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.356637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0805  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1673  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2936  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2987  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3100  IS1 transposase  46.67 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2198  IS1, transposase orfB  44.44 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2372  IS1 transposase  43.33 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2383  IS1 transposase  43.33 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.597317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2433  IS1 transposase  43.33 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0614  IS1 transposase  43.33 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261019  normal  0.286378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0544  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3343  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2300  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1801  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4477  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3919  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0949  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0561659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2427  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0509  IS1 OrfB  42.59 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3817  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4785  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4600  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3306  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1943  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1710  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.598125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0820  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2188  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00362179  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2841  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2454  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.583407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1988  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.151286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0623  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4216  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4009  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3839  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4527  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4298  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4260  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4117  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00102358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3833  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3231  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4620  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.523003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4561  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4283  IS1 transposase  42.59 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4780  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4713  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4275  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3473  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000708938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1074  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0958  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0022818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0852  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.157864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1875  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000296031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1548  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1233  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0434  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3453  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  42.59 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3196  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3115  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2913  IS1 transposase orfB  42.59 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>