More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3473 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  99.2 
 
 		 232 aa  262  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  100 
 
 		 232 aa  262  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00240  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.909946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02416  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1875  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000296031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3833  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3817  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4009  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0544  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3231  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3196  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3343  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3473  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000708938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3453  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3306  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2913  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4117  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00102358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2454  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.583407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1988  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.151286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1943  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4260  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3839  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4780  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4785  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0623  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4477  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0949  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0561659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0862  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.537368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0852  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.157864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4275  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4298  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4620  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.523003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3919  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0285  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4216  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1074  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0434  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4561  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0457  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4600  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0820  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0507  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00344  hypothetical protein  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00560  hypothetical protein  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00317  hypothetical protein  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00576  hypothetical protein  99.2 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01921  hypothetical protein  98.4 
 
 		 167 aa  256  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02231  hypothetical protein  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4905  IS1 transposase orfB  99.2 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>