More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1878 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1878  ubiquinone biosynthesis protein  100 
 
 
551 aa  1124    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0603  unusual protein kinase  43.48 
 
 
549 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.73 
 
 
558 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 
558 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.29 
 
 
556 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.07 
 
 
582 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.78 
 
 
558 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
526 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.32 
 
 
558 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.66 
 
 
554 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  28.02 
 
 
557 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  28.72 
 
 
557 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.99 
 
 
559 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.68 
 
 
561 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.83 
 
 
563 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  29.59 
 
 
560 aa  203  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  29.9 
 
 
558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.04 
 
 
578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  27.76 
 
 
599 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.36 
 
 
566 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.45 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  27.77 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.65 
 
 
568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.46 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  27.34 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.02 
 
 
562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  27.08 
 
 
571 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  30.56 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  29.52 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.2 
 
 
561 aa  197  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  29.77 
 
 
558 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.4 
 
 
564 aa  194  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  29.08 
 
 
583 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.47 
 
 
544 aa  192  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  30.35 
 
 
525 aa  192  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  26.65 
 
 
549 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.64 
 
 
517 aa  190  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  29.81 
 
 
567 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  29.64 
 
 
565 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  26.52 
 
 
561 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  28.28 
 
 
556 aa  190  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.66 
 
 
549 aa  190  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  26.33 
 
 
584 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  27.77 
 
 
552 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 
557 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30 
 
 
573 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  27.75 
 
 
543 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.97 
 
 
559 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  28.29 
 
 
552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.65 
 
 
555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  27.53 
 
 
556 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  28.89 
 
 
559 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  29.11 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  27.53 
 
 
543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  29.27 
 
 
619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  27.34 
 
 
555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  29.67 
 
 
560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  26.52 
 
 
561 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.65 
 
 
504 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
578 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  28.54 
 
 
559 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  29.78 
 
 
556 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  27.34 
 
 
549 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  26.36 
 
 
562 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  29.98 
 
 
559 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  29.44 
 
 
556 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  27.16 
 
 
557 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  27.34 
 
 
549 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.19 
 
 
559 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  26.36 
 
 
562 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  28.74 
 
 
569 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  27.78 
 
 
560 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  30.45 
 
 
659 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.17 
 
 
560 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  28.96 
 
 
557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  29.51 
 
 
555 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  26.12 
 
 
545 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.24 
 
 
592 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  29.98 
 
 
555 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  28.11 
 
 
545 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  30.48 
 
 
541 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.81 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  28.96 
 
 
557 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  28.19 
 
 
549 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.57 
 
 
547 aa  180  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.96 
 
 
557 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  28.29 
 
 
572 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.41 
 
 
666 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  28.25 
 
 
689 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  29.27 
 
 
555 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  28.92 
 
 
544 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  28.84 
 
 
562 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  27.98 
 
 
572 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  28.43 
 
 
559 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  29.82 
 
 
547 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  28.37 
 
 
574 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  29.06 
 
 
544 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.07 
 
 
546 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.6 
 
 
530 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.52 
 
 
522 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>