10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2553 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2553  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  29.47 
 
 		 438 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.67 
 
 		 1838 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.75 
 
 		 2807 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.93 
 
 		 1275 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1289 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  29.05 
 
 		 974 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  33.53 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  34.58 
 
 		 1127 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.28 
 
 		 435 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>