295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0068 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0068  polyphosphate kinase-related protein  100 
 
 
127 aa  259  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  49.52 
 
 
722 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  49.52 
 
 
722 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  47.75 
 
 
714 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  56.96 
 
 
720 aa  106  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  46.73 
 
 
736 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  46.08 
 
 
721 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  60 
 
 
712 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  45.1 
 
 
731 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  45.36 
 
 
713 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  42.06 
 
 
721 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1795  polyphosphate kinase  54.88 
 
 
828 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0761388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  42.2 
 
 
731 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3323  polyphosphate kinase  42.06 
 
 
727 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2068  polyphosphate kinase  41.28 
 
 
757 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3230  polyphosphate kinase  40.91 
 
 
772 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  53.73 
 
 
712 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  50 
 
 
727 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  44.25 
 
 
712 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  38.89 
 
 
747 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  38.89 
 
 
746 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  48.72 
 
 
705 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0133  polyphosphate kinase  39.68 
 
 
728 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0848217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  37.96 
 
 
747 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1031  polyphosphate kinase  40.54 
 
 
822 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  37.96 
 
 
727 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  43.02 
 
 
741 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  44.86 
 
 
743 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  42.5 
 
 
736 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  42.5 
 
 
736 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  56.41 
 
 
729 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  43.18 
 
 
823 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  49.21 
 
 
709 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  42.5 
 
 
740 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  41.28 
 
 
695 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  47.62 
 
 
709 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  38.53 
 
 
690 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  49.38 
 
 
775 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  35.19 
 
 
736 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  35.19 
 
 
736 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  34.55 
 
 
709 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  47.56 
 
 
765 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  38.89 
 
 
700 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  37.38 
 
 
707 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  45 
 
 
703 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  48.65 
 
 
694 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  37.65 
 
 
707 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  41.86 
 
 
691 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  38.46 
 
 
882 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  37.74 
 
 
702 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  39.42 
 
 
700 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  47.46 
 
 
692 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  39.76 
 
 
735 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  35.14 
 
 
708 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  36.11 
 
 
694 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  40.91 
 
 
813 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  34.95 
 
 
710 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.16 
 
 
708 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  39.74 
 
 
739 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  39.42 
 
 
712 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  37.38 
 
 
703 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  35.9 
 
 
745 aa  65.5  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  45.76 
 
 
694 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  32.11 
 
 
713 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  38.14 
 
 
701 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
708 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  43.75 
 
 
694 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
726 aa  63.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0938  polyphosphate kinase  36.26 
 
 
695 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  44.07 
 
 
692 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  34.55 
 
 
713 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  39 
 
 
717 aa  63.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  42.05 
 
 
727 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  39.25 
 
 
690 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  35.71 
 
 
687 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  40.45 
 
 
700 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
709 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  43.33 
 
 
692 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  41.11 
 
 
728 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  42.68 
 
 
790 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1780  Polyphosphate kinase  50.62 
 
 
798 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316915  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  42.5 
 
 
693 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1334  polyphosphate kinase  39.73 
 
 
697 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  42.17 
 
 
736 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  42.17 
 
 
723 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  43.37 
 
 
720 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  36.17 
 
 
696 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  38.14 
 
 
741 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  44.44 
 
 
705 aa  60.8  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  41.38 
 
 
762 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  39.33 
 
 
693 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  36.47 
 
 
724 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  39.8 
 
 
721 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1004  Polyphosphate kinase  43.75 
 
 
689 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.695447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1022  polyphosphate kinase  39.19 
 
 
697 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.665381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  40 
 
 
688 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  35.09 
 
 
731 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  37.8 
 
 
736 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  38.46 
 
 
693 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  38.71 
 
 
742 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>