299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3230 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3323  polyphosphate kinase  71.11 
 
 		 727 aa  1040    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  48.04 
 
 		 722 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3230  polyphosphate kinase  100 
 
 		 772 aa  1589    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  48.51 
 
 		 714 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  48.04 
 
 		 722 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  47.21 
 
 		 736 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0133  polyphosphate kinase  69.61 
 
 		 728 aa  1036    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0848217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1031  polyphosphate kinase  95.6 
 
 		 822 aa  1474    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  47.67 
 
 		 721 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2068  polyphosphate kinase  66.62 
 
 		 757 aa  1050    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  47.57 
 
 		 721 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1780  Polyphosphate kinase  60.62 
 
 		 798 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316915  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  48.84 
 
 		 729 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  44.85 
 
 		 823 aa  617  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  45.33 
 
 		 731 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1795  polyphosphate kinase  46.39 
 
 		 828 aa  614  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0761388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  45.17 
 
 		 731 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  45.92 
 
 		 720 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  48.61 
 
 		 708 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  48.38 
 
 		 760 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  46.02 
 
 		 769 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  46.72 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  47.1 
 
 		 763 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  45.68 
 
 		 882 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  44.26 
 
 		 743 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  47.99 
 
 		 700 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  48.67 
 
 		 708 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  47.73 
 
 		 702 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.86 
 
 		 728 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  45.03 
 
 		 729 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  47.78 
 
 		 693 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  46.73 
 
 		 712 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  45.39 
 
 		 743 aa  572  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  46.81 
 
 		 705 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  46.23 
 
 		 731 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  44.87 
 
 		 745 aa  571  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  46.06 
 
 		 762 aa  568  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  43.93 
 
 		 707 aa  568  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  44.25 
 
 		 713 aa  568  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  43.57 
 
 		 713 aa  568  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  45.83 
 
 		 750 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  46.8 
 
 		 742 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  46.8 
 
 		 742 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  46.8 
 
 		 742 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  45.01 
 
 		 737 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  44.68 
 
 		 766 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  45.13 
 
 		 744 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  43.56 
 
 		 709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  44.96 
 
 		 712 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  46.01 
 
 		 687 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  44.64 
 
 		 745 aa  556  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.04 
 
 		 709 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  42.25 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  45.48 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.19 
 
 		 709 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  43.23 
 
 		 709 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  47.03 
 
 		 703 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  45.52 
 
 		 738 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  46.17 
 
 		 730 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  44.44 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.85 
 
 		 702 aa  554  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  45.35 
 
 		 695 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  43.79 
 
 		 765 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  45.45 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  44.25 
 
 		 749 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  44.98 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  44.61 
 
 		 721 aa  548  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.19 
 
 		 715 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  43.89 
 
 		 713 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  43.1 
 
 		 749 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  43.71 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  43.06 
 
 		 707 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  44.67 
 
 		 743 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  43.07 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  44.1 
 
 		 726 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.37 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  39.68 
 
 		 694 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  40.75 
 
 		 692 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  42.29 
 
 		 813 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  40.15 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  44.13 
 
 		 701 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  40.72 
 
 		 770 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  42.29 
 
 		 728 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  42.84 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.36 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  41.79 
 
 		 717 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  41.17 
 
 		 727 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  40.06 
 
 		 705 aa  504  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  41.98 
 
 		 746 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  42.63 
 
 		 693 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  41.98 
 
 		 747 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  42.92 
 
 		 790 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  42.54 
 
 		 712 aa  501  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  43.21 
 
 		 690 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  41.84 
 
 		 747 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  39.47 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  42.02 
 
 		 693 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  41.48 
 
 		 788 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  40.34 
 
 		 736 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  40.34 
 
 		 736 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>