299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0133 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3323  polyphosphate kinase  88.32 
 
 
727 aa  1288    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  47.73 
 
 
722 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  49.57 
 
 
714 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  48.87 
 
 
736 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  47.73 
 
 
722 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1780  Polyphosphate kinase  66.62 
 
 
798 aa  939    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316915  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
721 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0133  polyphosphate kinase  100 
 
 
728 aa  1481    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0848217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  48.66 
 
 
721 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  51.41 
 
 
823 aa  641    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2068  polyphosphate kinase  69.97 
 
 
757 aa  1036    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1031  polyphosphate kinase  69.9 
 
 
822 aa  1035    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  51.52 
 
 
729 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3230  polyphosphate kinase  71.86 
 
 
772 aa  1040    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  46.89 
 
 
731 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  46.86 
 
 
731 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
720 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  50.44 
 
 
760 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  50 
 
 
769 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1795  polyphosphate kinase  48.05 
 
 
828 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0761388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  47.83 
 
 
750 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  46.29 
 
 
744 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  47.71 
 
 
708 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  47.77 
 
 
702 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  47.55 
 
 
882 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  47.86 
 
 
691 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  45.99 
 
 
766 aa  591  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  45.19 
 
 
713 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  46.87 
 
 
763 aa  588  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  45.69 
 
 
731 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  49.1 
 
 
705 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  46.99 
 
 
738 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  48.4 
 
 
696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  47.37 
 
 
721 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  46.85 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  45.67 
 
 
749 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  46.61 
 
 
703 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  43.7 
 
 
709 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  44.68 
 
 
729 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  46.06 
 
 
728 aa  575  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  47.98 
 
 
708 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  45.06 
 
 
765 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  45.13 
 
 
737 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  46.39 
 
 
712 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  45.06 
 
 
712 aa  568  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  48.57 
 
 
687 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  45.08 
 
 
741 aa  568  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  44.93 
 
 
749 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  45.61 
 
 
743 aa  567  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  46.78 
 
 
693 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  45.17 
 
 
742 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  47.24 
 
 
702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  45.17 
 
 
742 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  45.17 
 
 
742 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.65 
 
 
709 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  44.77 
 
 
707 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  44.73 
 
 
745 aa  561  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  45.29 
 
 
712 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  42.23 
 
 
705 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  42.35 
 
 
713 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  44.64 
 
 
743 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  45.2 
 
 
708 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.18 
 
 
709 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  44.96 
 
 
707 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  43.82 
 
 
713 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  46.11 
 
 
695 aa  552  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  43.71 
 
 
709 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  45.34 
 
 
700 aa  550  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  45.74 
 
 
730 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  47.54 
 
 
700 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  44.44 
 
 
745 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  45.44 
 
 
717 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.74 
 
 
696 aa  542  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  43.63 
 
 
715 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  47.35 
 
 
726 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  45.1 
 
 
813 aa  541  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  41.43 
 
 
692 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  43.43 
 
 
720 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  41.28 
 
 
692 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  41.73 
 
 
694 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  44.84 
 
 
697 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  42.02 
 
 
770 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  41.62 
 
 
692 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  45.23 
 
 
743 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  43.62 
 
 
693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  44.56 
 
 
728 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  43.08 
 
 
694 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  44.26 
 
 
688 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  44.99 
 
 
710 aa  505  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  42.67 
 
 
740 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  42.71 
 
 
701 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  42.6 
 
 
750 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  43.49 
 
 
736 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  42.29 
 
 
736 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  42.36 
 
 
790 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  42.58 
 
 
736 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  41.34 
 
 
749 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  41.51 
 
 
788 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  40.65 
 
 
731 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  40.36 
 
 
759 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>