298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1647 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1551  Polyphosphate kinase  49.42 
 
 
701 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.603175  hitchhiker  0.000343702 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  50 
 
 
720 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  54.89 
 
 
727 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  50 
 
 
723 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  55.03 
 
 
746 aa  782    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  53.75 
 
 
714 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1536  polyphosphate kinase  49.78 
 
 
737 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.753907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0581  polyphosphate kinase  50.15 
 
 
686 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  49.49 
 
 
700 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  54.31 
 
 
736 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  55.3 
 
 
740 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0788  polyphosphate kinase  48.96 
 
 
747 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  48.47 
 
 
690 aa  671    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  48.47 
 
 
690 aa  670    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  54.45 
 
 
736 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  100 
 
 
765 aa  1582    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  52.19 
 
 
693 aa  729    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  54.31 
 
 
693 aa  773    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  49.13 
 
 
694 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  50.22 
 
 
712 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  50.65 
 
 
688 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1626  polyphosphate kinase  48.82 
 
 
747 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  55.18 
 
 
690 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  54.17 
 
 
741 aa  779    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  54.89 
 
 
747 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4450  polyphosphate kinase  50.73 
 
 
753 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246923  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  53.94 
 
 
693 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  49.93 
 
 
687 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  56.06 
 
 
727 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  52.46 
 
 
703 aa  715    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  52.63 
 
 
690 aa  759    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  50.51 
 
 
691 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  49.38 
 
 
747 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1876  polyphosphate kinase  49.42 
 
 
701 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  54.07 
 
 
702 aa  727    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  50.8 
 
 
695 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  50.8 
 
 
693 aa  724    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  49.56 
 
 
687 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  50 
 
 
698 aa  656    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  55.04 
 
 
733 aa  775    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  93.31 
 
 
762 aa  1449    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  50.07 
 
 
693 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  54.29 
 
 
694 aa  746    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  50.82 
 
 
736 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  56.43 
 
 
736 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0570  polyphosphate kinase  50.15 
 
 
686 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0676435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  54.77 
 
 
694 aa  745    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  55.03 
 
 
747 aa  782    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1184  polyphosphate kinase  51.02 
 
 
687 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  55.99 
 
 
736 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1196  polyphosphate kinase  51.02 
 
 
687 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.905186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  50.88 
 
 
687 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  49.63 
 
 
691 aa  675    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  50.88 
 
 
687 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  75.95 
 
 
775 aa  1224    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  55.26 
 
 
739 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  50.44 
 
 
687 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1523  polyphosphate kinase  50 
 
 
686 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  49.56 
 
 
687 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1492  polyphosphate kinase  50 
 
 
686 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.352325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  57.83 
 
 
712 aa  768    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1299  polyphosphate kinase  48.96 
 
 
759 aa  680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  46.47 
 
 
708 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3601  polyphosphate kinase  46.08 
 
 
686 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.487429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.24 
 
 
727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2306  polyphosphate kinase  45.08 
 
 
772 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2622  polyphosphate kinase  42.45 
 
 
734 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.494843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  45.89 
 
 
708 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  43.16 
 
 
722 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  43.16 
 
 
722 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4920  polyphosphate kinase  43.54 
 
 
816 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268776  normal  0.200111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1480  polyphosphate kinase  43.04 
 
 
723 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3008  polyphosphate kinase  47.15 
 
 
698 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235985  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2378  polyphosphate kinase  42.9 
 
 
723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  43.02 
 
 
731 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  44.15 
 
 
703 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  43.9 
 
 
701 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.2 
 
 
731 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2017  polyphosphate kinase  43.26 
 
 
700 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.78 
 
 
721 aa  551  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  42.51 
 
 
743 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  42.4 
 
 
695 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  44.48 
 
 
700 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.1 
 
 
714 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  43.57 
 
 
721 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  41.78 
 
 
713 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1296  polyphosphate kinase  43.66 
 
 
717 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  42.27 
 
 
736 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  43.13 
 
 
702 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  41.23 
 
 
720 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.38 
 
 
710 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  44.71 
 
 
705 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  42.63 
 
 
790 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  43.87 
 
 
700 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  41.99 
 
 
788 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  41.71 
 
 
743 aa  529  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  41.91 
 
 
788 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  41.91 
 
 
788 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  42.59 
 
 
720 aa  528  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  41.63 
 
 
749 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>